Legendiline mangasarja näitab meile alternatiivset 20. sajandit, kus maagia ja alkeemia käivad koos tehnoloogilise protsessiga. Süžee keskmes on kaks venda, Edward ja Alphonse, kelle katse päästa surnud ema alkeemia abil viib kohutavate tagajärgedeni. Edwardil pole muud valikut kui astuda armeesse, et leida viis oma venna ja omaenda moonutatud keha taastamiseks.